Jednou z pravdepodobných príčin vzniku viacerých pásov v PCR je nešpecifické žíhanie primérov. ... Príliš veľa cyklov PCR (viac ako 30) má tiež potenciál spôsobiť viac pásiem v dôsledku zvýšenej šance na chybu v každom cykle. Kontaminácia DNA je ďalším možným faktorom.
- Prečo je v gélovej elektroforéze viac pásiem?
- Ako riešite problémy s viacerými pásmami v PCR?
- Čo sú to pásy PCR?
- Prečo je v RAPD viac pásiem?
Prečo je v gélovej elektroforéze viac pásiem?
Gélová matrica funguje ako sito: menšie molekuly DNA migrujú rýchlejšie ako väčšie, takže molekuly DNA rôznych veľkostí sa počas elektroforézy rozdelia do odlišných pásov.
Ako riešite problémy s viacerými pásmami v PCR?
Populárne odpovede (1)
- urobte reakciu s negatívnou kontrolou (bez šablóny). ...
- Zvýšte teplotu žíhania. ...
- Znovu navrhnite základné nátery a predĺžte 3 ′. ...
- Predĺžte dobu žíhania, ak sú nešpecifické produkty kratšie ako váš cieľ. ...
- Použite menej templátu DNA.
- Vyskúšajte touch-down PCR.
Čo sú to pásy PCR?
Slabý horný pás (298 bp) identifikuje produkt PCR amplifikovaný z jedného cieľa v genóme. Jasnejší dolný pás (238 bp) identifikuje viaccieľový produkt PCR s 10 kópiami opakovaní v rovnakom genóme. Obe tieto cieľové oblasti obsahujú 100% identické väzbové miesta pre priméry.
Prečo je v RAPD viac pásiem?
Pretože RAPD sú generované náhodným žíhaním pomocou 10-nukleotidového priméru, dalo by sa očakávať, že po každom použitom priméri bude mať množstvo fragmentov. ... V závislosti od toho, čo porovnávate (viac -menej geneticky príbuzné), sa počet polymorfných pásov bude líšiť.